Chapter 5. 자료조사
연구 주제를 선정한 후에는 해당 주제에 대해 무엇이 알려져 있고, 어떤 문제가 아직 해결되지 않았는지 파악하기 위해 관련 자료를 체계적으로 조사합니다. 자료 조사의 목적은 단순히 많은 논문을 찾는 것이 아닙니다. 관련 분야의 배경지식을 확장하고, 주요 연구 질문과 연구 동향을 이해하며, 졸업논문에서 중점적으로 다룰 연구들을 선정하는 것이 중요합니다. 자료 조사를 통해 다음 질문에 답할 수 있어야 […]
Classes
Posts related to the classes by Prof. Seungpyo Hong in Jeonbuk National University (JBNU)
Lecture materials will be provided in this category. You need to log in the site for full access of the contents. The students enrolled in classes taught by Prof. Seungpyo Hong will be granted access to the posts.
Chapter 6. 초안 작성
자료 조사를 통해 주요 논문을 선정하고 내용을 비교·분석하였다면, 실제 논문을 작성하기 전에 Outline을 작성합니다. Outline은 논문의 설계도에 해당합니다. 논문에서 어떤 내용을 어떤 순서로 설명할 것인지 정하고, 각 부분에서 어떤 논문을 근거로 사용할 것인지 미리 배치합니다. 좋은 Outline이 만들어지면 각 항목을 문장과 문단으로 확장하여 논문의 초안을 작성할 수 있습니다. 1. Outline 작성 Outline에는 논문의 제목과 주요
Chapter 4. 연구 주제 선정
연구 주제 선정은 단순히 흥미 있는 분야를 고르는 것이 아니라, 관심 있는 생명현상을 발견하고 → 관련 연구를 탐색하고 → 구체적인 질문을 만들고 → 기존 연구를 비교·분석할 수 있는 범위로 좁혀 가는 과정입니다. 학부 졸업논문에서는 완전히 새로운 연구 질문을 제시하기보다, 관심 있는 분야의 최근 연구를 조사하고 2–3편의 주요 논문을 중심으로 현재까지 알려진 내용과 아직 해결되지 않은
Chapter 4. 연구 주제 선정 Read More »
Chapter 3. 학부졸업논문 작성
1. 졸업논문의 구성 학부 과정에서 완전히 새로운 연구를 기획하고 수행하여 독창적인 연구 결과를 도출하는 것은 현실적으로 쉽지 않습니다. 그러나 관심 있는 연구 주제를 선정하고, 관련된 선행연구를 조사·정리하여 현재까지 밝혀진 내용을 이해하고, 이를 바탕으로 연구의 한계와 앞으로 필요한 연구 방향을 제시하는 것은 충분히 가능합니다. 분자생물학 전공의 학부 졸업논문은 이러한 과정을 통해 과학적 문헌을 탐색하고, 이해하고, 종합하여
Chapter 3. 학부졸업논문 작성 Read More »
Chapter 2. 논문의 구성과 연구 절차
1. 논문의 구성 논문은 연구를 통해 얻은 과학적 지식과 그 근거를 다른 연구자들과 공유하기 위한 문서입니다. 따라서 연구의 배경과 목적, 연구 방법, 결과 및 그 의미를 정확하고 명확하게 전달하는 것이 중요합니다. 이를 위해 과학 논문은 일반적으로 일정한 구조를 따릅니다. 대표적인 과학 논문의 구성은 IMRAD 형식입니다. 필요에 따라 Conclusion (결론)을 별도의 절로 구성하여 주요 결과와 연구의
Chapter 2. 논문의 구성과 연구 절차 Read More »
Chapter 1. 과학적 연구 과정
과학적 연구 과정 과학적 연구는 자연과 생명 현상을 이해하고 새로운 지식을 만들어 가는 체계적인 과정입니다. 연구자는 관찰이나 기존의 지식에서 질문을 발견하고, 이를 해결하기 위한 가설이나 연구 목표를 세운 뒤, 실험과 분석을 통해 근거를 얻고 그 의미를 해석합니다. 과학적 연구를 이해하기 쉽게 다음과 같은 단계로 나눌 수 있습니다. 그러나 실제 연구가 항상 이 순서대로 진행되는 것은
Chapter 1. 과학적 연구 과정 Read More »
Protein Structure Modeling with ColabFold – AlphaFold2
Introduction ColabFold는 Google Colab 환경에서 AlphaFold2를 수행할 수 있는 기능을 제공한다. Google 계정이 있으면 웹 브라우져를 통해 접근하여 단백질 구조 모델링을 수행할 수 있다. 여기서는 ColabFold를 이용해 단백질 서열을 이용해 구조를 예측하는 실습을 실행하고, 생성된 파일을 분석합니다. ColabFold 1. 접속 ColabFold는 아래 link를 통해 접속합니다. 아래와 같은 JupyterNotebook 화면을 확인할 수 있습니다. 2. 서열 입력
Protein Structure Modeling with ColabFold – AlphaFold2 Read More »
Protein Structure Modeling with Modeller
Introduction Modeller는 Andrej Sali 연구실에서 개발된 대표적인 상동 모델링(homology modeling) 도구이다. 본 실습에서는 해당 연구실에서 제공하는 튜토리얼을 통해 단백질 구조 모델링의 전반적인 과정을 학습한다. Tutorial 요약 여기서 연습하는 과장은 아래와 같이 구성되어 있다. Tutorial 각 과정에 대한 자세한 설명은 아래 링크를 참고한다. https://salilab.org/modeller/tutorial/basic.html 여기서는 편의상 해당 tutorial 의 예제에 기반하여, directory 구조만 약간 변형한 예제를
Protein Structure Modeling with Modeller Read More »
PyMOL 기초 사용법
목적 PyMOL을 활용하여 단백질의 구조를 시각화 하는 방법을 배운다. Introduction 단백질은 유전자 발현의 산물로 세포의 분자적 기능의 기본 단위체이며, 단백질의 기능은 입체 구조와 밀접히 관련되어 있다. 단백질의 기능을 분자적 수준에서 이해하기 위해서는 단백질의 입체 구조에 대한 이해가 필요하다. 단백질의 입체 구조 정보는 X-ray crystallography 혹은 NMR과 같은 실험적 기법을 통해 규명할 수 있다. 또한 연구
Mid-term project – Deep Learning and Drug Discovery
1. 소개 본 과제는 신약 개발 과정 중 hit discovery 과정에 대해 복습하고, 실제 연구에서 데이터와 deep learning 기반 방법이 어떻게 활용될 수 있는지를 이해하는 것을 목표로 합니다. 특히, 데이터를 수집하고 분석하며, computational 및 AI 기반 방법을 이용해 문제를 해결하는 과정을 직접 경험함으로써 데이터 기반 연구(data-driven research)의 전체 흐름을 이해하는 데 목적이 있습니다. 학생들은 과제
Mid-term project – Deep Learning and Drug Discovery Read More »