Companion animal
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Multi-omics analysis
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Docker – 설치
이 문서는 docker 공식 싸이트를 참고해 작성하였다 (https://docs.docker.com/engine/install/ubuntu/). (optional) 이전 버전 docker 지우기 오래된 docker engine이 있는 경우, 아래 명령을 통해 삭제한다. 1. Installation 1.1. Set-up repository Docker engine은 docker hub (repository)을 통해 다른 개발자가 만든 docker image를 활용할 수 있다. 이를 위해 docker engine 설치에 앞서, repository 접근 설정이 필요하다. Install prerequisite packages for
Docker
Introduction Docker는 프로그램 설치와 배포를 도와주는 platform이다. 하나의 컴퓨터에 독립적인 공간을 만드는 기술이다. 일종의 가상의 컴퓨터를 만드는 것으로 생각할 수도 있다. 다만, CPU와 memory 등의 자원은 원래 컴퓨터와 공유한다는 특징이 있다. Python 환경 관리를 넘어서, 시스템의 환경 까지 관리해야 할 경우 docker가 유용하게 사용될 수 있다. Docker image를 공유함으로써 프로그램을 개발한 환경과 거의 동일한 환경을
Tutorial – Microbiome Analysis (amplicon sequencing)
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Anaconda
Introduction Anaconda는 Python 과학 계산 프로그램 플랫폼이다. 컴퓨터 작동 환경을 관리하는 conda를 이용해 numpy, scipy 등 다양한 package를 관리한다. 다양한 과학 계산 프로그램을 이 플랫폼을 이용해 활용할 수 있다. 환경의 개념을 설명하고, Anaconda 설치 방법과 새로운 환경 만드는 방법과 사용하는 방법을 설명한다. 환경(environment)은 프로그램이 실행되는 분리된 가상 공간(isolated virtual space)이다. 프로그램이 실행되는 공간을 분리함으로써 하나의
평생지도교수제
1. 소개 평생지도교수제는 입학에서 졸업까지 학업, 생활, 진로, 취업 등 대학 생활 전반에 대해 지도하는 과정입니다. 처음 전북대학교에 오신 여러분들께서 학교에 적응하는 것을 돕는 제도입니다. 이 글은 분자생물학과 조교수 홍승표의 상담을 위한 사항을 포함하고 있습니다. 구체적인 상담은 학과별로, 지도교수님 별로 상이할 수 있습니다. 상담 일정 및 방법에 대해서는 학과 사무실 혹은 지도교수님과 상의하시기 바람니다. 2.
Journals by subjects
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Mid-term project – Bioinformatics
소개 생물정보학 중간 과제는 학습한 생물정보학 방법을 활용하여 유전자의 기능을 탐색하는 연구 과제입니다. 연구 시작 전 terminal 창에서 다음 명령을 실행해 필요한 파일을 복사합니다. MidTermProject 폴더에는 I.ResearchNote.ipynb와 II.Report.ipynb 2개의 JupyterNotebook 파일이 있습니다. I.ResearchNote.ipynb에는 연구 과정에서 수집한 정보를 기록하고, II.Report.ipynb 에는 연구 수행 완료 결과를 정리하여 기록합니다. I. 과제 진행 연구 과제를 진행하면서 수집한 정보들을 I.ResearchNote.ipynb에
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Markdown
0. JupyterNotebook에서 Markdown code block 만들기 Cell(Block)을 클릭하고, type을 선택 버튼을 클릭한다. Markdown을 선택한다. 1. Markdown 문법 1.1. Headings (제목) Markdown에서는 ‘#’을 문장 맨 앞에 표기하여 제목을 만들 수 있습니다. 1.2. 강조 아래와 같이 ‘**’ 와 ‘*’를 이용하여 단어나 문장을 강조할 수 있다. 1.3. 목록 (순서 없는 목록) ‘*’와 빈칸 한개(space)를 이용하여 순서 없는 목록을