sphong

Assistant professor Department of Molecular Biology Jeonbuk National University

Seungpyo Hong

PyMol Open Source 윈도우 설치

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소개 PyMol은 단백질과 같은 분자의 3차원 구조를 시각화하는 도구이다. PyMol은 Schrondinger (https://www.schrodinger.com/products/pymol)에서 유료로 사용할 수 있는 프로그램이나, open source version도 존재하며, 여기서는 Open Source version 설치 방법을 소개한다. 1. Anaconda 설치 Window에서 PyMol을 사용하기 위해서 환경 관리 프로그램인 anaconda를 설치한다. 이미 컴퓨터에 설치가 되어 있다면, 다음 단계로 넘어간다. 다운로드 URL: https://www.anaconda.com/download 2. PyMol 설치하기 2.1.

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Installation of LEfSe

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Introduction LEfSe (Linear discriminant analysis Effect Size)는 통계 분석을 통해 특정 class와 관련있는 feature를 찾는 방법이다. Conda를 이용해 간단하게 설치할 수 있어야 하나, library version 차이로 인해 설치가 원활히 되지 않는 경우가 발생한다. 여기서는 Installation (conda) 아래 명령어 실행을 통해 LEfSe를 설치한다. 다만, 아래 설치는 매우 제한적인 시스템에서 테스트한 결과로, 일부 시스템에서는 정상적으로 설치되지 않을

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연구실 지원

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소개 데이터 분석을 통해 생명 현상을 연구하고 싶으신 분들이나, 해당 연구를 위한 도구 개발에 관심이 있으신 분들을 환영합니다. 의생명 데이터 과학 실험실(BDSL)에서 같이 연구할 대학원생을 모집하고 있습니다. 생물정보학 연구에 관심 있으신 분들은 저희 연구실에서 진행하고 있는 연구에 대해 살펴보시고, 관심 있으시면 지원 부탁드립니다. 생명 현상에 대해 관심이 있으시면서 동시에 데이터 분석과 같은 전산적 방법론에 관심이

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