Uncategorized

Ubuntu 서버 비밀번호 변경

비밀번호 변경 방법 아래 명령을 이용하여 비밀번호를 변경할 수 있다. 먼저, 설정된 비밀번호를 입력하고, 새로 설정할 비밀번호를 입력한 후 새 비밀번호를 다시 한번 입력하여 변경할 수 있다. 비밀번호 생성 규칙 학교 서버에 대한 해킹 시도가 많습니다. 다소 복잡한 비밀번호를 설정해야 합니다. 아래의 규칙을 고려합니다. 개인적인 정보를 영문자판에서 한글로 입력하면 좋습니다. 아래 예시는 일반적인 단어를 이용한

Ubuntu 서버 비밀번호 변경 Read More »

데이터베이스 사용 실습 – FireProtDB

Introduction FireProtDB는 단백질 열안정성에 대한 정보를 수집하고 정리한 데이터베이스이다. 이 데이터 베이스를 이용하여 program (Python)을 이용한 데이터베이스 접근 및 활용 방법을 학습한다. 실습 code 아래 code는 FireProtDB에 접속해서 Tm 값과 ddG 값을 가져오고, 각 값의 분포를 나타내는 프로그램이다. 이와 같이 데이터베이스와 프로그램을 연동하여 데이터 분석을 진행할 수 있다. 1. Load libraries 데이터 분석에 사용할 프로그램(library)를

데이터베이스 사용 실습 – FireProtDB Read More »

MobaXterm 설치와 서버 접속

Introduction MobaXterm은 SSH client로 리눅스 시스템에 원격 접속하기 위해 사용할 수 있는 프로그램이다.다음 URL을 통해 홈페이지에 접속할 수 있으며 설치 프로그램을 받을 수 있다 (https://mobaxterm.mobatek.net/). 개인적 활용시 Home Edition을 이용하여 무료로 사용할 수 있다. 설치 프로그램 받기 아래 URL에서 “Home Edition” 버전을 받는다. (Download now) https://mobaxterm.mobatek.net/download.html (참고) 개인 컴퓨터에 설치하는 경우 installer edition를 설치한다. 공용

MobaXterm 설치와 서버 접속 Read More »

SNUH data curation

요약 임상 데이터의 체계적 수집 및 관리를 위해 데이터를 재구성하였습니다. 1개의 표에 모든 정보를 기록하고 있던 기존 데이터 수집 체계를 5개의 excel 파일, 18개의 table로 분리하였고, 기존 자료 (2024년 6월 28일 기준) 내용을 입력하였습니다. 비슷한 의미를 지닌 단위를 데이터를 분류하여, 각각의 데이터를 쉽게 관리하는 것이 목적입니다. 데이터 관리 측면에서는 출력 (fetch), 입력 (insert), 수정 (update),

SNUH data curation Read More »

Understanding the Concept of Statistics Through Examples

Library loading and functions RNA expression and protein expression Measure of the concentration of the protein X Interepretation A Statistic: A Single Number that Represents the Data Simple Evaluation Random Incidences 0.5148158483005283-0.68221888442359540.43813562081717283-0.24953267639975260.10300182994047037 Statistical Inference P-value Statistical inference

Understanding the Concept of Statistics Through Examples Read More »

Pattern – Bioinformatics

Introduction Pattern은 반복되는 무늬나 서열을 의미한다. DNA 서열과 단백질 서열에는 다양한 종류의 pattern이 존재한다. 생체에서 이러한 패턴이 나타나는 이유는 기능과 밀접히 연관되어 있다. 동일한 transcription factor (TF) 에 의해 발현이 조절되는 유전자의 promoter에는 해당 TF가 인지하고 결합할 수 있는 특정 DNA 서열이 있다. 유사한 기능을 하는 단백질의 경우 해당 기능 수행을 위한 부위가 잘 보존되어

Pattern – Bioinformatics Read More »

Scroll to Top