March 2025

Introduction Modeller는 Andrej Sali 연구실에서 개발된 대표적인 상동 모델링(homology modeling) 도구이다. 본 실습에서는 해당 연구실에서 제공하는 튜토리얼을 통해 단백질 구조 모델링의 전반적인 과정을 학습한다. Tutorial 요약 여기서 연습하는 과장은 아래와 같이 구성되어 있다. Tutorial 각 과정에 대한 자세한 설명은 아래 링크를 참고한다. https://salilab.org/modeller/tutorial/basic.html 여기서는 편의상 해당 tutorial 의 예제에 기반하여, directory 구조만 약간 변형한 예제를 […]

목적 PyMOL을 활용하여 단백질의 구조를 시각화 하는 방법을 배운다. Introduction 단백질은 유전자 발현의 산물로 세포의 분자적 기능의 기본 단위체이며, 단백질의 기능은 입체 구조와 밀접히 관련되어 있다. 단백질의 기능을 분자적 수준에서 이해하기 위해서는 단백질의 입체 구조에 대한 이해가 필요하다. 단백질의 입체 구조 정보는 X-ray crystallography 혹은 NMR과 같은 실험적 기법을 통해 규명할 수 있다. 또한 연구